MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar kurstaki str. HD73 plasmid pHT7

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020243	A	6	6	98	103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020243	ACA	2	6	113	118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020243	T	7	7	142	148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020243	CA	3	6	151	156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020243	A	6	6	413	418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020243	A	6	6	423	428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020243	GATATA	2	12	445	456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020243	A	7	7	460	466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020243	AGT	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020243	ATC	2	6	514	519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020243	AT	3	6	528	533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020243	AAAT	2	8	551	558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020243	AAATTT	2	12	571	582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020243	A	6	6	586	591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020243	T	6	6	595	600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020243	TGC	2	6	643	648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020243	TTTC	2	8	660	667	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020243	A	6	6	673	678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020243	GA	3	6	679	684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020243	TC	3	6	709	714	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020243	ATC	2	6	729	734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020243	CAC	2	6	740	745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_020243	T	8	8	2075	2082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020243	CTTT	2	8	2464	2471	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020243	TAAA	2	8	2475	2482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020243	CAAG	2	8	2490	2497	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020243	A	6	6	2770	2775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020243	AGG	2	6	2793	2798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020243	A	6	6	2838	2843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020243	ACT	2	6	2906	2911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020243	GAA	2	6	2954	2959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020243	A	7	7	2977	2983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020243	A	7	7	2987	2993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020243	GGA	2	6	3107	3112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020243	TA	3	6	3138	3143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020243	TTA	2	6	3228	3233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020243	CAA	2	6	3255	3260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020243	ATT	2	6	3311	3316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020243	CAAA	2	8	3352	3359	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020243	GTA	2	6	3453	3458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020243	GAA	2	6	3477	3482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020243	TCA	2	6	3507	3512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020243	T	6	6	3557	3562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020243	AAAC	2	8	3566	3573	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020243	TAT	2	6	3615	3620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020243	A	6	6	3656	3661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020243	CA	3	6	3668	3673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020243	CCT	2	6	3677	3682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_020243	GTT	2	6	3979	3984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020243	AAT	2	6	3990	3995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020243	CCG	2	6	5306	5311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_020243	GAA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020243	CAT	2	6	5511	5516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020243	TCCG	2	8	5533	5540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020243	CTC	2	6	5567	5572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_020243	AT	3	6	5595	5600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020243	A	6	6	5840	5845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020243	GTG	2	6	5882	5887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020243	GTAT	2	8	5980	5987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020243	A	7	7	6020	6026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020243	T	6	6	6048	6053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020243	TCA	2	6	6060	6065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020243	CCA	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_020243	CA	3	6	6100	6105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020243	AACA	2	8	6206	6213	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020243	AGAA	2	8	6219	6226	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020243	TCA	2	6	6333	6338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020243	ATT	2	6	6373	6378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020243	AT	3	6	6399	6404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020243	TAC	2	6	6590	6595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020243	T	6	6	6601	6606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020243	T	6	6	6637	6642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020243	GTT	2	6	6672	6677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020243	T	6	6	6676	6681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020243	A	6	6	6738	6743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020243	TTAAA	2	10	6772	6781	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020243	TA	3	6	6789	6794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020243	TTAT	2	8	6804	6811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020243	TTTA	3	12	6812	6823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020243	TTAAA	2	10	6842	6851	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020243	ATT	2	6	6867	6872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020243	TTG	2	6	6884	6889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020243	AT	3	6	6964	6969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020243	A	7	7	6976	6982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020243	A	6	6	7083	7088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020243	AGAA	2	8	7096	7103	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020243	AAC	2	6	7124	7129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020243	ACT	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020243	A	6	6	7200	7205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020243	ACT	2	6	7215	7220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020243	TAAC	2	8	7224	7231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_020243	A	6	6	7326	7331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020243	CAAA	2	8	7343	7350	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020243	TATT	2	8	7358	7365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020243	TAA	2	6	7441	7446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020243	GA	3	6	7481	7486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020243	TAAA	2	8	7521	7528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020243	A	6	6	7536	7541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020243	TCA	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020243	T	6	6	7562	7567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020243	T	6	6	7583	7588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020243	CAT	2	6	7589	7594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020243	TAA	2	6	7612	7617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020243	TA	3	6	7624	7629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.